Τα σεμινάρια που οργάνωσε το Ινστιτούτο στόχο έχουν να παρουσιάσουν τα αποτελέσματα έρευνας επιστημόνων από διάφορους κλάδους των Βυζαντινών Σπουδών. Τα σεμινάρια απευθύνονται στους πανεπιστημιακούς καθηγητές, ερευνητές και φοιτητές και είναι ανοικτά και σε άλλους ακροατές.

Υπεύθυνη για το πρόγραμμα των σεμιναρίων: Ελένη Σαράντη.

Σεμινάρια κατά το ακαδημαϊκό έτος 2009-2010:

1. Νίκος Τσιβίκης, επικεφαλής ελληνικών ανασκαφών του Αμορίου: Ανακαλύπτοντας μια μεσοβυζαντινή θεματική πρωτεύουσα και μία ολόκληρη αρχαιολογία (25.11.2009).

2. Ιωάννης Θεοδωρακόπουλος: Η Άλωση του Αμορίου το 838. Οι γραπτές πηγές και τα αρχαιολογικά τεκμήρια (9.12.2009).

3. Παρασκευάς Ματάλας, Πανεπιστήμιο Κρήτης: Η ανακάλυψη του βυζαντινού Μυστρά. (14.4.2010).

4. Ευγενία Χαλκιά, Προϊσταμένη της 26ης Εφορείας Βυζαντινών Αρχαιοτήτων: Πρόσφατα αρχαιολογικά ευρήματα από τη βυζαντινή Νικόπολη. (6.5.2010).